Por mais de dois séculos, o Japão se manteve isolado do restante do mundo. Uma das principais razões para o banimento de estrangeiros no país foi em consequência da Rebelião de Shimabara, uma revolta de samurais e camponeses cristãos contra o governo do clã Tokugawa, ocorrida em 1637-1638.
Santos e Guerreiros procura trazer luz a este evento histórico e resgatar a memória de grandes samurais como Miyamoto Musashi, que nunca fora derrotado em uma luta e o jovem Shiro Amakusa, o líder da rebelião.
A influência portuguesa está presente na obra através de Benjamin e sua fé inabalável, e sua amizade conturbada com Kenjiro, o guerreiro renegado, que poderá trazer esperança ou morte para os moradores de um distante vilarejo.